Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms