Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef6A2A8M8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms