Protein–RNA interactions for Protein: A2A654

Bptf, Bromodomain PHD finger transcription factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BptfA2A654 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BptfA2A654 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BptfA2A654 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
BptfA2A654 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BptfA2A654 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BptfA2A654 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms