Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms