Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms