Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms