Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUK1

AW822073, Expressed sequence AW822073, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW822073A0A0N4SUK1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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AW822073A0A0N4SUK1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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AW822073A0A0N4SUK1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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AW822073A0A0N4SUK1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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AW822073A0A0N4SUK1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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AW822073A0A0N4SUK1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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AW822073A0A0N4SUK1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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AW822073A0A0N4SUK1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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AW822073A0A0N4SUK1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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AW822073A0A0N4SUK1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AW822073A0A0N4SUK1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms