Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUH6

Rbm8a2, RNA-binding protein 8A, mousemouse

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms