Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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