Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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