Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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