Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRP6

Gm28576, Predicted gene 28576, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28576A0A087WRP6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28576A0A087WRP6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28576A0A087WRP6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms