Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ces2a-204ENSMUST00000164182 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cct7-203ENSMUST00000204592 1544 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cuta-202ENSMUST00000114935 597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ntpcr-208ENSMUST00000152189 822 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24039-201ENSMUST00000157878 132 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20508-201ENSMUST00000172480 487 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20492-201ENSMUST00000172591 286 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6g6c-203ENSMUST00000174876 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 2010009K17Rik-201ENSMUST00000186977 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 D830044I16Rik-205ENSMUST00000206296 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr925-ps1-201ENSMUST00000217295 780 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC122354.1-201ENSMUST00000222328 702 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 4930428N03Rik-205ENSMUST00000225654 892 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29108-201ENSMUST00000186020 1498 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8603-201ENSMUST00000115649 1515 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29427-201ENSMUST00000188520 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Nsg2-202ENSMUST00000093219 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s2-201ENSMUST00000101968 119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s194-201ENSMUST00000104719 119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9434-201ENSMUST00000118975 813 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 E330017L17Rik-202ENSMUST00000139190 861 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s112-201ENSMUST00000178208 119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s125-201ENSMUST00000179377 119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s120-201ENSMUST00000180000 119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms