Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32591-201ENSMUST00000203038 414 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16252-202ENSMUST00000215604 1232 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rnase11-201ENSMUST00000076106 713 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Defa22-201ENSMUST00000098897 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Calcoco2-201ENSMUST00000068686 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43225-201ENSMUST00000201381 1439 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn8-201ENSMUST00000049697 2356 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Sult6b2-201ENSMUST00000111768 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Apol11b-204ENSMUST00000181467 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11888-201ENSMUST00000120471 810 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12248-201ENSMUST00000137124 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl19-203ENSMUST00000140546 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22762-201ENSMUST00000157395 137 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15833-201ENSMUST00000161563 957 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27500-201ENSMUST00000184331 336 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45521-201ENSMUST00000211339 676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC158531.1-201ENSMUST00000224617 457 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr96-201ENSMUST00000078209 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1425-201ENSMUST00000087828 939 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Folr2-201ENSMUST00000094141 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46992-201ENSMUST00000222120 1389 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC132467.1-201ENSMUST00000226498 1845 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms