Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Magea8-201ENSMUST00000070141 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Pde6h-202ENSMUST00000137768 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5397-201ENSMUST00000121081 1453 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv3-4-201ENSMUST00000103401 360 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Etfbkmt-202ENSMUST00000111547 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22198-201ENSMUST00000122659 307 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rspo4os-201ENSMUST00000152229 1281 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 1810007D17Rik-201ENSMUST00000187629 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6749-201ENSMUST00000203838 405 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10113-201ENSMUST00000072437 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19173-201ENSMUST00000204494 1523 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37536-201ENSMUST00000194710 2491 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Il1r2-201ENSMUST00000027243 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms