Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms