Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac5Q9Z2V6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms