Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mbd3Q9Z2D8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms