Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip6Q9Z1Y4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip6Q9Z1Y4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms