Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VarsQ9Z1Q9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms