Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms