Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne6Q9Z140 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne6Q9Z140 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms