Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms