Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn3Q9Z0Y1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms