Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms