Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn15Q9Z0S5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms