Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L0

Tpbg, Trophoblast glycoprotein, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbgQ9Z0L0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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TpbgQ9Z0L0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpbgQ9Z0L0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TpbgQ9Z0L0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TpbgQ9Z0L0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TpbgQ9Z0L0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TpbgQ9Z0L0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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TpbgQ9Z0L0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TpbgQ9Z0L0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TpbgQ9Z0L0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TpbgQ9Z0L0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TpbgQ9Z0L0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TpbgQ9Z0L0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TpbgQ9Z0L0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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TpbgQ9Z0L0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TpbgQ9Z0L0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms