Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stxbp4Q9WV89 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms