Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme4Q9WV84 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms