Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1a4Q9WV27 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms