Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam50aQ9WV03 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Fam50aQ9WV03 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam50aQ9WV03 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms