Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms