Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lemd3Q9WU40 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms