Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms