Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Usp18Q9WTV6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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Usp18Q9WTV6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Usp18Q9WTV6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Usp18Q9WTV6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Usp18Q9WTV6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Usp18Q9WTV6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Usp18Q9WTV6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp18Q9WTV6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp18Q9WTV6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms