Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK0

Nupr1, Nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupr1Q9WTK0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nupr1Q9WTK0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupr1Q9WTK0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupr1Q9WTK0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupr1Q9WTK0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupr1Q9WTK0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupr1Q9WTK0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupr1Q9WTK0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupr1Q9WTK0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupr1Q9WTK0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupr1Q9WTK0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nupr1Q9WTK0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nupr1Q9WTK0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nupr1Q9WTK0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nupr1Q9WTK0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms