Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50bQ9WTJ8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam50bQ9WTJ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms