Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms