Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms