Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slit2Q9R1B9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms