Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms