Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0X4

Acot9, Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot9Q9R0X4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot9Q9R0X4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot9Q9R0X4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms