Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Wdr54Q9R0D8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms