Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Plod2Q9R0B9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod2Q9R0B9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod2Q9R0B9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod2Q9R0B9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod2Q9R0B9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod2Q9R0B9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod2Q9R0B9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod2Q9R0B9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod2Q9R0B9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod2Q9R0B9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod2Q9R0B9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod2Q9R0B9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod2Q9R0B9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms