Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Nek3Q9R0A5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Nek3Q9R0A5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Nek3Q9R0A5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Nek3Q9R0A5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Nek3Q9R0A5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Nek3Q9R0A5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Nek3Q9R0A5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek3Q9R0A5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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