Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf4Q9QZS2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms