Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Rdh11Q9QYF1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh11Q9QYF1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh11Q9QYF1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh11Q9QYF1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh11Q9QYF1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh11Q9QYF1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Rdh11Q9QYF1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh11Q9QYF1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh11Q9QYF1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh11Q9QYF1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh11Q9QYF1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh11Q9QYF1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh11Q9QYF1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh11Q9QYF1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Rdh11Q9QYF1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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Rdh11Q9QYF1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Rdh11Q9QYF1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rdh11Q9QYF1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rdh11Q9QYF1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rdh11Q9QYF1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rdh11Q9QYF1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rdh11Q9QYF1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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