Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms