Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms