Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY9

Pex3, Peroxisomal biogenesis factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex3Q9QXY9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pex3Q9QXY9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex3Q9QXY9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex3Q9QXY9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms